Çay ağacı yağı, cilt bakımı ürünlerinde, saç bakımı ürünlerinde, sabunlarda, losyonlarda ve diğer kozmetik ürünlerde sıklıkla kullanılmaktadır. Ciltteki akne, sivilce ve diğer cilt problemlerine karşı doğal bir çözüm olarak tercih edilir. Ayrıca mantar enfeksiyonlarına, egzamaya ve kepek gibi saç ve cilt sorunlarına karşı da kullanılabilir.
Ancak, çay ağacı yağının saf formu cilde direkt uygulanmamalıdır çünkü konsantresi cilde zarar verebilir. Genellikle bir taşıyıcı yağ ile seyreltilerek kullanılır. Ayrıca, çay ağacı yağına alerjisi olan kişilerin kullanmadan önce doktorlarına danışmaları önerilir.