19 Mart 1999 doğumlu Francisco Ortega, futbola ülkesi Arjantin'in Velez Sarsfield altyapısı'nda başladı. Bu takımın alt yaş kategorilerinde başarılı performans sergileyen genç sol bek, Ocak 2018'de A Takıma yükselmeyi başardı. Kariyeri boyunca toplam 81 resmi maça çıkan Ortega, 1 gol, 9 asist kaydetti.
Bu sezon Velez Sarsfield ile 3 karşılaşmada görev alan 22 yaşındaki Francisco Ortega, skora katkı yapamadı.