"Kapsül endoskopi; sebebi bulunamayan sindirim sistemi kanamalarında, kanamanın yerinin tespitinde, Crohn hastalığının ince barsak tutulumu tespitinde, Çölyak hastalığı teşhis ve takibinde, ince barsak ve sindirim sistemi polipleri tespitinde ve ya kanseri taramasında kullanılabilir.
Kapsülü yutma işleminden bir gün önce tanesiz ve sulu gıdalar tüketilmelidir. Çorbalar dahil olmak üzere tüm gıdalar sıvı ve tanesiz olmalıdır. Ihlamur, elma suyu ve çay gibi berrak sıvı gıdalar alınabilir. Fakat vişne suyu, nar suyu ve ya şalgam gibi kırmızı renkli içecekler, tetkik sırasında kan görüntüsü verebileceklerinden dolayı tercih edilmemelidir. Kapsül öncesi sıklıkla görüntü kalitesini artırmak ve kapsülün barsaktan ilerleyişini kolaylaştırmak için ishal yapıcı bir ilaç da uygulanır.