Kabak çekirdeği, uzun bir tarihçeye sahip olan ve belirli bir kişi veya grup tarafından "keşfedilmiş" olarak tanımlanamayacak kadar eski bir gıda maddesidir.
Kabak ve dolayısıyla kabak çekirdeği, Meksika ve Kuzey Amerika'nın yerli halkları tarafından binlerce yıl önce yetiştirilmeye başlanmıştır. Bu bölgelerde, kabak çekirdekleri, besin değeri yüksek ve korunması kolay bir besin kaynağı olarak kullanılmıştır.