Migren, baş ağrısının bir diğer yaygın nedenidir ve genellikle yoğun, zonklayıcı bir ağrı olarak kendini gösterir. Migrenin kesin nedeni bilinmemekle birlikte, genetik ve çevresel faktörlerin bir kombinasyonundan kaynaklandığı düşünülmektedir. Migren, genellikle mide bulantısı, kusma ve ışığa karşı hassasiyet gibi semptomlarla birlikte gelir. Migren atağını tetikleyen faktörler arasında hormonal değişiklikler, bazı yiyecekler, alkol ve uyku düzenindeki değişiklikler yer alabilir.